Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms