Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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SP6Q3SY56 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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SP6Q3SY56 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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