Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms