Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SNAPC1Q16533 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SNAPC1Q16533 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SNAPC1Q16533 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SNAPC1Q16533 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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