Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
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CNGA3Q16281 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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CNGA3Q16281 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
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CNGA3Q16281 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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CNGA3Q16281 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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