Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms