Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HNF4GQ14541 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms