Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMB3Q13751 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms