Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA7Q13683 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms