Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
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