Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms