Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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LSAMPQ13449 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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LSAMPQ13449 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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LSAMPQ13449 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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