Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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