Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CBX3Q13185 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CBX3Q13185 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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