Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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