Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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