Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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