Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AP1B1Q10567 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
AP1B1Q10567 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
AP1B1Q10567 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
AP1B1Q10567 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
AP1B1Q10567 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AP1B1Q10567 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AP1B1Q10567 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AP1B1Q10567 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AP1B1Q10567 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms