Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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RASGEF1BQ0VAM2 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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RASGEF1BQ0VAM2 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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