Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms