Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms