Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ARF6P62330 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ARF6P62330 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ARF6P62330 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARF6P62330 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARF6P62330 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARF6P62330 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARF6P62330 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARF6P62330 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARF6P62330 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARF6P62330 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARF6P62330 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARF6P62330 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARF6P62330 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARF6P62330 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARF6P62330 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ARF6P62330 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARF6P62330 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARF6P62330 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ARF6P62330 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARF6P62330 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARF6P62330 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARF6P62330 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARF6P62330 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARF6P62330 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARF6P62330 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARF6P62330 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ARF6P62330 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARF6P62330 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARF6P62330 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARF6P62330 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARF6P62330 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ARF6P62330 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARF6P62330 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARF6P62330 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARF6P62330 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARF6P62330 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARF6P62330 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARF6P62330 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARF6P62330 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARF6P62330 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARF6P62330 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARF6P62330 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARF6P62330 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARF6P62330 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARF6P62330 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARF6P62330 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARF6P62330 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARF6P62330 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ARF6P62330 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ARF6P62330 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARF6P62330 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARF6P62330 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ARF6P62330 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ARF6P62330 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ARF6P62330 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ARF6P62330 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ARF6P62330 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARF6P62330 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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ARF6P62330 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARF6P62330 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARF6P62330 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARF6P62330 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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ARF6P62330 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARF6P62330 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARF6P62330 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARF6P62330 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARF6P62330 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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ARF6P62330 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARF6P62330 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARF6P62330 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARF6P62330 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARF6P62330 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARF6P62330 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARF6P62330 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARF6P62330 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARF6P62330 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARF6P62330 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARF6P62330 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARF6P62330 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARF6P62330 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARF6P62330 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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