Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF3P61204 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF3P61204 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF3P61204 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF3P61204 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF3P61204 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF3P61204 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF3P61204 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF3P61204 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF3P61204 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF3P61204 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF3P61204 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF3P61204 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF3P61204 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF3P61204 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF3P61204 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF3P61204 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF3P61204 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF3P61204 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF3P61204 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF3P61204 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF3P61204 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF3P61204 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF3P61204 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF3P61204 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF3P61204 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF3P61204 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF3P61204 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF3P61204 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF3P61204 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF3P61204 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF3P61204 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF3P61204 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF3P61204 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF3P61204 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF3P61204 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF3P61204 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF3P61204 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF3P61204 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF3P61204 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF3P61204 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF3P61204 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF3P61204 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF3P61204 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF3P61204 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF3P61204 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF3P61204 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF3P61204 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF3P61204 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF3P61204 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF3P61204 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF3P61204 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF3P61204 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF3P61204 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF3P61204 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF3P61204 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF3P61204 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF3P61204 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF3P61204 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF3P61204 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF3P61204 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF3P61204 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF3P61204 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF3P61204 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF3P61204 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF3P61204 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF3P61204 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF3P61204 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF3P61204 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF3P61204 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF3P61204 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF3P61204 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF3P61204 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF3P61204 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF3P61204 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF3P61204 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF3P61204 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF3P61204 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF3P61204 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF3P61204 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF3P61204 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF3P61204 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF3P61204 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF3P61204 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF3P61204 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF3P61204 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF3P61204 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF3P61204 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF3P61204 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF3P61204 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF3P61204 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF3P61204 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF3P61204 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF3P61204 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF3P61204 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF3P61204 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF3P61204 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARF3P61204 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARF3P61204 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ARF3P61204 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms