Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP107P57740 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP107P57740 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP107P57740 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP107P57740 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP107P57740 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP107P57740 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP107P57740 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP107P57740 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP107P57740 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP107P57740 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP107P57740 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP107P57740 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP107P57740 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP107P57740 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP107P57740 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP107P57740 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP107P57740 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP107P57740 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP107P57740 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP107P57740 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP107P57740 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP107P57740 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP107P57740 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP107P57740 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP107P57740 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP107P57740 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP107P57740 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP107P57740 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP107P57740 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP107P57740 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP107P57740 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP107P57740 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP107P57740 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP107P57740 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP107P57740 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP107P57740 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP107P57740 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP107P57740 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP107P57740 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP107P57740 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP107P57740 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP107P57740 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP107P57740 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP107P57740 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP107P57740 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP107P57740 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP107P57740 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP107P57740 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP107P57740 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP107P57740 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP107P57740 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP107P57740 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP107P57740 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP107P57740 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP107P57740 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP107P57740 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP107P57740 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP107P57740 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP107P57740 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP107P57740 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP107P57740 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP107P57740 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP107P57740 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP107P57740 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP107P57740 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP107P57740 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP107P57740 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP107P57740 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP107P57740 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP107P57740 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP107P57740 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP107P57740 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP107P57740 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP107P57740 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP107P57740 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP107P57740 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP107P57740 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP107P57740 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP107P57740 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP107P57740 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP107P57740 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP107P57740 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP107P57740 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP107P57740 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP107P57740 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP107P57740 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP107P57740 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP107P57740 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP107P57740 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP107P57740 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP107P57740 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP107P57740 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP107P57740 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP107P57740 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP107P57740 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP107P57740 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP107P57740 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP107P57740 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP107P57740 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms