Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms