Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERFP50548 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERFP50548 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERFP50548 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERFP50548 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERFP50548 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERFP50548 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERFP50548 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERFP50548 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERFP50548 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERFP50548 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERFP50548 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERFP50548 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERFP50548 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERFP50548 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERFP50548 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERFP50548 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERFP50548 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERFP50548 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERFP50548 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERFP50548 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERFP50548 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERFP50548 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERFP50548 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERFP50548 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERFP50548 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERFP50548 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ERFP50548 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERFP50548 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERFP50548 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERFP50548 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERFP50548 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERFP50548 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERFP50548 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERFP50548 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERFP50548 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERFP50548 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERFP50548 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERFP50548 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERFP50548 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ERFP50548 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERFP50548 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERFP50548 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERFP50548 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERFP50548 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERFP50548 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERFP50548 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERFP50548 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERFP50548 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERFP50548 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERFP50548 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERFP50548 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ERFP50548 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERFP50548 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERFP50548 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERFP50548 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERFP50548 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERFP50548 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERFP50548 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERFP50548 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERFP50548 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERFP50548 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERFP50548 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERFP50548 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ERFP50548 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERFP50548 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERFP50548 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERFP50548 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERFP50548 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERFP50548 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERFP50548 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERFP50548 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERFP50548 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERFP50548 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ERFP50548 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERFP50548 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ERFP50548 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERFP50548 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERFP50548 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERFP50548 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERFP50548 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERFP50548 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERFP50548 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERFP50548 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERFP50548 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERFP50548 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERFP50548 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERFP50548 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERFP50548 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERFP50548 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ERFP50548 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERFP50548 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ERFP50548 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERFP50548 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERFP50548 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERFP50548 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERFP50548 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ERFP50548 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERFP50548 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERFP50548 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms