Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC4A3P48751 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC4A3P48751 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC4A3P48751 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC4A3P48751 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC4A3P48751 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC4A3P48751 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC4A3P48751 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC4A3P48751 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC4A3P48751 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC4A3P48751 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC4A3P48751 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC4A3P48751 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC4A3P48751 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC4A3P48751 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC4A3P48751 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC4A3P48751 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC4A3P48751 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC4A3P48751 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC4A3P48751 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC4A3P48751 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC4A3P48751 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC4A3P48751 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms