Protein–RNA interactions for Protein: P41440

SLC19A1, Folate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A1P41440 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms