Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJC1P36383 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJC1P36383 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJC1P36383 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJC1P36383 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJC1P36383 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJC1P36383 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GJC1P36383 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GJC1P36383 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJC1P36383 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GJC1P36383 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJC1P36383 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJC1P36383 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJC1P36383 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJC1P36383 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GJC1P36383 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJC1P36383 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GJC1P36383 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GJC1P36383 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJC1P36383 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJC1P36383 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJC1P36383 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJC1P36383 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJC1P36383 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJC1P36383 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJC1P36383 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJC1P36383 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJC1P36383 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
GJC1P36383 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GJC1P36383 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GJC1P36383 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GJC1P36383 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GJC1P36383 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GJC1P36383 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GJC1P36383 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GJC1P36383 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GJC1P36383 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GJC1P36383 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GJC1P36383 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GJC1P36383 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GJC1P36383 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GJC1P36383 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GJC1P36383 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GJC1P36383 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJC1P36383 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJC1P36383 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJC1P36383 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJC1P36383 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJC1P36383 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJC1P36383 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJC1P36383 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJC1P36383 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GJC1P36383 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJC1P36383 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJC1P36383 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GJC1P36383 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJC1P36383 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJC1P36383 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJC1P36383 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJC1P36383 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GJC1P36383 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJC1P36383 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJC1P36383 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJC1P36383 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJC1P36383 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJC1P36383 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJC1P36383 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJC1P36383 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJC1P36383 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJC1P36383 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJC1P36383 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJC1P36383 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJC1P36383 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJC1P36383 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJC1P36383 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJC1P36383 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJC1P36383 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJC1P36383 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJC1P36383 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJC1P36383 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJC1P36383 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJC1P36383 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJC1P36383 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJC1P36383 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJC1P36383 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJC1P36383 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJC1P36383 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJC1P36383 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJC1P36383 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJC1P36383 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJC1P36383 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJC1P36383 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJC1P36383 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJC1P36383 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJC1P36383 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJC1P36383 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJC1P36383 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJC1P36383 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJC1P36383 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJC1P36383 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms