Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPOP30536 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPOP30536 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPOP30536 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPOP30536 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPOP30536 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPOP30536 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPOP30536 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
TSPOP30536 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
TSPOP30536 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
TSPOP30536 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
TSPOP30536 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPOP30536 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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