Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms