Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PLNP26678 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PLNP26678 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PLNP26678 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PLNP26678 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PLNP26678 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PLNP26678 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PLNP26678 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
PLNP26678 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PLNP26678 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PLNP26678 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PLNP26678 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PLNP26678 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PLNP26678 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PLNP26678 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PLNP26678 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PLNP26678 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PLNP26678 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PLNP26678 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PLNP26678 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PLNP26678 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms