Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMO2P25791 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMO2P25791 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMO2P25791 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMO2P25791 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMO2P25791 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMO2P25791 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMO2P25791 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMO2P25791 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMO2P25791 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LMO2P25791 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LMO2P25791 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMO2P25791 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMO2P25791 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMO2P25791 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMO2P25791 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMO2P25791 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LMO2P25791 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LMO2P25791 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LMO2P25791 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMO2P25791 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMO2P25791 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMO2P25791 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMO2P25791 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LMO2P25791 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LMO2P25791 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LMO2P25791 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LMO2P25791 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LMO2P25791 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LMO2P25791 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LMO2P25791 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
LMO2P25791 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LMO2P25791 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO2P25791 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO2P25791 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO2P25791 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO2P25791 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO2P25791 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO2P25791 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO2P25791 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO2P25791 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO2P25791 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO2P25791 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO2P25791 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO2P25791 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO2P25791 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO2P25791 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO2P25791 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO2P25791 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO2P25791 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO2P25791 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO2P25791 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO2P25791 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO2P25791 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO2P25791 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO2P25791 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO2P25791 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO2P25791 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO2P25791 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO2P25791 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO2P25791 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO2P25791 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO2P25791 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO2P25791 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO2P25791 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO2P25791 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO2P25791 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO2P25791 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO2P25791 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO2P25791 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO2P25791 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO2P25791 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO2P25791 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO2P25791 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO2P25791 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO2P25791 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO2P25791 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO2P25791 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO2P25791 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO2P25791 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMO2P25791 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMO2P25791 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMO2P25791 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMO2P25791 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMO2P25791 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMO2P25791 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMO2P25791 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMO2P25791 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMO2P25791 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMO2P25791 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMO2P25791 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMO2P25791 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMO2P25791 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMO2P25791 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMO2P25791 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMO2P25791 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMO2P25791 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMO2P25791 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LMO2P25791 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMO2P25791 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms