Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
APCP25054 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
APCP25054 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
APCP25054 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
APCP25054 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
APCP25054 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
APCP25054 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
APCP25054 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
APCP25054 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
APCP25054 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
APCP25054 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
APCP25054 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
APCP25054 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
APCP25054 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
APCP25054 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
APCP25054 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
APCP25054 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
APCP25054 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
APCP25054 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
APCP25054 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
APCP25054 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
APCP25054 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
APCP25054 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
APCP25054 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
APCP25054 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
APCP25054 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
APCP25054 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
APCP25054 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
APCP25054 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
APCP25054 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
APCP25054 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
APCP25054 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
APCP25054 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
APCP25054 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
APCP25054 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
APCP25054 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
APCP25054 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
APCP25054 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
APCP25054 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
APCP25054 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
APCP25054 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
APCP25054 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
APCP25054 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
APCP25054 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
APCP25054 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
APCP25054 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
APCP25054 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
APCP25054 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
APCP25054 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
APCP25054 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
APCP25054 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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APCP25054 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APCP25054 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APCP25054 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
APCP25054 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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APCP25054 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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APCP25054 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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APCP25054 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APCP25054 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APCP25054 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APCP25054 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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APCP25054 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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APCP25054 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
APCP25054 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APCP25054 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APCP25054 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APCP25054 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
APCP25054 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
APCP25054 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APCP25054 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APCP25054 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APCP25054 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APCP25054 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APCP25054 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APCP25054 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APCP25054 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APCP25054 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APCP25054 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APCP25054 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APCP25054 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APCP25054 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APCP25054 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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