Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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PTPRBP23467 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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PTPRBP23467 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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PTPRBP23467 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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PTPRBP23467 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
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PTPRBP23467 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRBP23467 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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PTPRBP23467 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRBP23467 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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PTPRBP23467 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRBP23467 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRBP23467 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRBP23467 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRBP23467 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRBP23467 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRBP23467 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
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