Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms