Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRHP20396 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRHP20396 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRHP20396 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRHP20396 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRHP20396 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRHP20396 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRHP20396 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRHP20396 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRHP20396 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRHP20396 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRHP20396 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRHP20396 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRHP20396 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRHP20396 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRHP20396 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRHP20396 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRHP20396 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRHP20396 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRHP20396 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRHP20396 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRHP20396 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRHP20396 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRHP20396 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRHP20396 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRHP20396 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRHP20396 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRHP20396 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRHP20396 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRHP20396 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRHP20396 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRHP20396 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRHP20396 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRHP20396 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRHP20396 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRHP20396 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRHP20396 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRHP20396 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRHP20396 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRHP20396 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRHP20396 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRHP20396 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRHP20396 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRHP20396 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRHP20396 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRHP20396 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRHP20396 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRHP20396 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRHP20396 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRHP20396 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRHP20396 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRHP20396 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRHP20396 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TRHP20396 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRHP20396 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRHP20396 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRHP20396 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRHP20396 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRHP20396 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRHP20396 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TRHP20396 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRHP20396 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRHP20396 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TRHP20396 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRHP20396 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TRHP20396 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRHP20396 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRHP20396 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRHP20396 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRHP20396 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRHP20396 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRHP20396 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRHP20396 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRHP20396 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRHP20396 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TRHP20396 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRHP20396 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRHP20396 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRHP20396 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TRHP20396 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRHP20396 TMEM14EP-202ENST00000639378 1296 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TRHP20396 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TRHP20396 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRHP20396 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRHP20396 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRHP20396 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRHP20396 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRHP20396 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRHP20396 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRHP20396 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRHP20396 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRHP20396 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRHP20396 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRHP20396 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRHP20396 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRHP20396 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRHP20396 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRHP20396 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRHP20396 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRHP20396 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms