Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC9A1P19634 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms