Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPB42P16452 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPB42P16452 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EPB42P16452 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPB42P16452 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPB42P16452 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPB42P16452 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPB42P16452 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPB42P16452 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPB42P16452 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPB42P16452 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPB42P16452 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPB42P16452 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPB42P16452 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPB42P16452 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EPB42P16452 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPB42P16452 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPB42P16452 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPB42P16452 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPB42P16452 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPB42P16452 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPB42P16452 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPB42P16452 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPB42P16452 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPB42P16452 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPB42P16452 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPB42P16452 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPB42P16452 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPB42P16452 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPB42P16452 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPB42P16452 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPB42P16452 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPB42P16452 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EPB42P16452 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPB42P16452 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPB42P16452 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EPB42P16452 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPB42P16452 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPB42P16452 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPB42P16452 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EPB42P16452 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPB42P16452 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EPB42P16452 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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EPB42P16452 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPB42P16452 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPB42P16452 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPB42P16452 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPB42P16452 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPB42P16452 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPB42P16452 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPB42P16452 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPB42P16452 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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EPB42P16452 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPB42P16452 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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EPB42P16452 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPB42P16452 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPB42P16452 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPB42P16452 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPB42P16452 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPB42P16452 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPB42P16452 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPB42P16452 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPB42P16452 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPB42P16452 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPB42P16452 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPB42P16452 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPB42P16452 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPB42P16452 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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EPB42P16452 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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EPB42P16452 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPB42P16452 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPB42P16452 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPB42P16452 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPB42P16452 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPB42P16452 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPB42P16452 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPB42P16452 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPB42P16452 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPB42P16452 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPB42P16452 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPB42P16452 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPB42P16452 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPB42P16452 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EPB42P16452 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPB42P16452 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPB42P16452 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPB42P16452 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPB42P16452 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPB42P16452 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPB42P16452 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPB42P16452 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPB42P16452 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPB42P16452 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPB42P16452 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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