Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB1P16220 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB1P16220 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB1P16220 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB1P16220 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB1P16220 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB1P16220 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB1P16220 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB1P16220 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB1P16220 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB1P16220 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB1P16220 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB1P16220 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB1P16220 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB1P16220 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB1P16220 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB1P16220 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB1P16220 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB1P16220 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB1P16220 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB1P16220 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB1P16220 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB1P16220 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB1P16220 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB1P16220 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB1P16220 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB1P16220 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB1P16220 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB1P16220 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB1P16220 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB1P16220 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB1P16220 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB1P16220 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB1P16220 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB1P16220 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB1P16220 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB1P16220 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB1P16220 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB1P16220 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB1P16220 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB1P16220 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB1P16220 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB1P16220 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB1P16220 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB1P16220 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB1P16220 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB1P16220 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB1P16220 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB1P16220 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB1P16220 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB1P16220 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB1P16220 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB1P16220 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB1P16220 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB1P16220 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB1P16220 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB1P16220 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB1P16220 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB1P16220 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB1P16220 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB1P16220 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB1P16220 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB1P16220 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB1P16220 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB1P16220 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB1P16220 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB1P16220 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB1P16220 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB1P16220 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB1P16220 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB1P16220 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB1P16220 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB1P16220 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB1P16220 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB1P16220 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB1P16220 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB1P16220 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB1P16220 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB1P16220 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB1P16220 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB1P16220 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB1P16220 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB1P16220 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB1P16220 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB1P16220 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB1P16220 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB1P16220 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB1P16220 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB1P16220 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB1P16220 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB1P16220 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB1P16220 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREB1P16220 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREB1P16220 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREB1P16220 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREB1P16220 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREB1P16220 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREB1P16220 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREB1P16220 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREB1P16220 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms