Protein–RNA interactions for Protein: P15328

FOLR1, Folate receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOLR1P15328 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms