Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC172P0C7W6 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC172P0C7W6 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC172P0C7W6 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC172P0C7W6 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC172P0C7W6 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC172P0C7W6 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC172P0C7W6 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC172P0C7W6 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC172P0C7W6 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC172P0C7W6 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC172P0C7W6 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC172P0C7W6 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC172P0C7W6 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC172P0C7W6 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC172P0C7W6 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC172P0C7W6 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC172P0C7W6 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC172P0C7W6 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC172P0C7W6 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC172P0C7W6 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC172P0C7W6 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC172P0C7W6 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC172P0C7W6 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC172P0C7W6 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC172P0C7W6 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC172P0C7W6 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC172P0C7W6 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC172P0C7W6 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC172P0C7W6 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC172P0C7W6 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC172P0C7W6 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC172P0C7W6 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC172P0C7W6 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC172P0C7W6 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC172P0C7W6 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC172P0C7W6 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC172P0C7W6 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC172P0C7W6 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC172P0C7W6 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC172P0C7W6 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC172P0C7W6 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC172P0C7W6 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC172P0C7W6 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC172P0C7W6 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC172P0C7W6 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC172P0C7W6 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC172P0C7W6 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC172P0C7W6 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC172P0C7W6 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC172P0C7W6 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC172P0C7W6 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC172P0C7W6 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms