Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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