Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX4O95219 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX4O95219 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX4O95219 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX4O95219 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX4O95219 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX4O95219 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX4O95219 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX4O95219 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX4O95219 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX4O95219 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX4O95219 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX4O95219 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX4O95219 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX4O95219 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX4O95219 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX4O95219 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX4O95219 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX4O95219 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX4O95219 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX4O95219 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX4O95219 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX4O95219 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX4O95219 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX4O95219 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX4O95219 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX4O95219 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX4O95219 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX4O95219 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX4O95219 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX4O95219 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX4O95219 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX4O95219 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX4O95219 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX4O95219 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX4O95219 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX4O95219 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX4O95219 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX4O95219 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX4O95219 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX4O95219 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX4O95219 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX4O95219 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX4O95219 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX4O95219 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX4O95219 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX4O95219 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX4O95219 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX4O95219 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX4O95219 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX4O95219 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX4O95219 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX4O95219 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX4O95219 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX4O95219 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX4O95219 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX4O95219 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX4O95219 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX4O95219 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX4O95219 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX4O95219 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX4O95219 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX4O95219 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX4O95219 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX4O95219 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX4O95219 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX4O95219 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX4O95219 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX4O95219 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX4O95219 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX4O95219 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX4O95219 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX4O95219 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX4O95219 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX4O95219 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX4O95219 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX4O95219 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX4O95219 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX4O95219 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX4O95219 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNX4O95219 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNX4O95219 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNX4O95219 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNX4O95219 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNX4O95219 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNX4O95219 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNX4O95219 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNX4O95219 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX4O95219 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX4O95219 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX4O95219 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX4O95219 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX4O95219 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX4O95219 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX4O95219 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX4O95219 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX4O95219 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX4O95219 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX4O95219 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX4O95219 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms