Protein–RNA interactions for Protein: O43772

SLC25A20, Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A20O43772 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 GLI3-201ENST00000395925 8208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms