Protein–RNA interactions for Protein: O00203

AP3B1, AP-3 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B1O00203 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B1O00203 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms