Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms