Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf170A2RU37 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms