Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms