Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms